MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter pylori 35A chromosome

Total Repeats: 32651

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017360	AAG	2	6	29	34	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017360	CTT	2	6	47	52	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017360	AAAGA	2	10	70	79	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017360	ATT	2	6	87	92	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017360	TATCG	2	10	112	121	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_017360	TGAA	2	8	131	138	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017360	CTT	2	6	164	169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017360	CAA	2	6	233	238	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384895179
9	NC_017360	GGA	2	6	239	244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384895179
10	NC_017360	AAC	2	6	277	282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384895179
11	NC_017360	GTG	2	6	392	397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384895180
12	NC_017360	TAA	2	6	550	555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384895180
13	NC_017360	ACT	3	9	611	619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384895180
14	NC_017360	AGG	2	6	675	680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384895180
15	NC_017360	GT	3	6	687	692	0 %	50 %	50 %	0 %	384895180
16	NC_017360	GA	3	6	725	730	50 %	0 %	50 %	0 %	384895180
17	NC_017360	TTA	3	9	798	806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384895180
18	NC_017360	TAA	2	6	832	837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384895180
19	NC_017360	TGTAA	2	10	941	950	40 %	40 %	20 %	0 %	384895180
20	NC_017360	GAG	2	6	974	979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384895180
21	NC_017360	GTT	2	6	1054	1059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384895180
22	NC_017360	AATA	2	8	1091	1098	75 %	25 %	0 %	0 %	384895180
23	NC_017360	TTA	2	6	1130	1135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384895180
24	NC_017360	TGA	2	6	1180	1185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384895180
25	NC_017360	AGG	2	6	1206	1211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384895180
26	NC_017360	C	7	7	1226	1232	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
27	NC_017360	T	6	6	1247	1252	0 %	100 %	0 %	0 %	384895181
28	NC_017360	CT	3	6	1254	1259	0 %	50 %	0 %	50 %	384895181
29	NC_017360	T	7	7	1268	1274	0 %	100 %	0 %	0 %	384895181
30	NC_017360	ATT	2	6	1335	1340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384895181
31	NC_017360	TAA	2	6	1483	1488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384895182
32	NC_017360	AATA	2	8	1538	1545	75 %	25 %	0 %	0 %	384895182
33	NC_017360	ACTT	2	8	1557	1564	25 %	50 %	0 %	25 %	384895182
34	NC_017360	TAA	2	6	1708	1713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384895182
35	NC_017360	TGT	2	6	1719	1724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384895182
36	NC_017360	TAA	2	6	1799	1804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017360	T	6	6	1820	1825	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017360	TTA	2	6	1865	1870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384895183
39	NC_017360	A	7	7	1875	1881	100 %	0 %	0 %	0 %	384895183
40	NC_017360	AGA	2	6	1930	1935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384895183
41	NC_017360	CCA	2	6	1947	1952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384895183
42	NC_017360	CTTT	2	8	1973	1980	0 %	75 %	0 %	25 %	384895183
43	NC_017360	TGA	2	6	2079	2084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384895183
44	NC_017360	GAA	2	6	2099	2104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384895183
45	NC_017360	A	6	6	2111	2116	100 %	0 %	0 %	0 %	384895183
46	NC_017360	TCA	2	6	2161	2166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384895183
47	NC_017360	A	6	6	2175	2180	100 %	0 %	0 %	0 %	384895183
48	NC_017360	AGCGGG	2	12	2202	2213	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384895184
49	NC_017360	TCTTT	2	10	2260	2269	0 %	80 %	0 %	20 %	384895184
50	NC_017360	A	6	6	2333	2338	100 %	0 %	0 %	0 %	384895184
51	NC_017360	TGA	2	6	2372	2377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384895184
52	NC_017360	A	7	7	2377	2383	100 %	0 %	0 %	0 %	384895184
53	NC_017360	TCT	2	6	2430	2435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384895184
54	NC_017360	G	7	7	2456	2462	0 %	0 %	100 %	0 %	384895184
55	NC_017360	AGC	2	6	2499	2504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384895184
56	NC_017360	ATCC	2	8	2613	2620	25 %	25 %	0 %	50 %	384895184
57	NC_017360	CCAC	2	8	2665	2672	25 %	0 %	0 %	75 %	384895184
58	NC_017360	A	6	6	2706	2711	100 %	0 %	0 %	0 %	384895184
59	NC_017360	ATT	2	6	2732	2737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384895184
60	NC_017360	A	6	6	2752	2757	100 %	0 %	0 %	0 %	384895184
61	NC_017360	GC	3	6	2758	2763	0 %	0 %	50 %	50 %	384895184
62	NC_017360	ACA	2	6	2770	2775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384895184
63	NC_017360	AGA	2	6	2816	2821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384895184
64	NC_017360	AAAG	2	8	2883	2890	75 %	0 %	25 %	0 %	384895184
65	NC_017360	TTTA	2	8	2896	2903	25 %	75 %	0 %	0 %	384895184
66	NC_017360	AAC	2	6	2908	2913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384895184
67	NC_017360	AGA	2	6	2930	2935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384895184
68	NC_017360	CAA	2	6	2999	3004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384895184
69	NC_017360	GAT	2	6	3073	3078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384895184
70	NC_017360	CA	3	6	3196	3201	50 %	0 %	0 %	50 %	384895185
71	NC_017360	CCT	2	6	3219	3224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384895185
72	NC_017360	AAC	2	6	3232	3237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384895185
73	NC_017360	AGC	2	6	3299	3304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384895185
74	NC_017360	ATT	2	6	3476	3481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384895185
75	NC_017360	GA	3	6	3582	3587	50 %	0 %	50 %	0 %	384895185
76	NC_017360	CTTT	2	8	3601	3608	0 %	75 %	0 %	25 %	384895185
77	NC_017360	GC	3	6	3633	3638	0 %	0 %	50 %	50 %	384895185
78	NC_017360	CATC	2	8	3693	3700	25 %	25 %	0 %	50 %	384895185
79	NC_017360	A	6	6	3761	3766	100 %	0 %	0 %	0 %	384895185
80	NC_017360	TATT	2	8	3864	3871	25 %	75 %	0 %	0 %	384895185
81	NC_017360	CAAC	2	8	3894	3901	50 %	0 %	0 %	50 %	384895185
82	NC_017360	CAT	3	9	3915	3923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384895185
83	NC_017360	TCA	2	6	3932	3937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384895185
84	NC_017360	TGAAGC	2	12	3990	4001	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384895185
85	NC_017360	T	6	6	4022	4027	0 %	100 %	0 %	0 %	384895185
86	NC_017360	T	6	6	4047	4052	0 %	100 %	0 %	0 %	384895185
87	NC_017360	CAA	2	6	4081	4086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384895185
88	NC_017360	ATT	2	6	4130	4135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384895185
89	NC_017360	T	6	6	4155	4160	0 %	100 %	0 %	0 %	384895185
90	NC_017360	T	7	7	4168	4174	0 %	100 %	0 %	0 %	384895185
91	NC_017360	T	6	6	4211	4216	0 %	100 %	0 %	0 %	384895186
92	NC_017360	TTAA	2	8	4221	4228	50 %	50 %	0 %	0 %	384895186
93	NC_017360	AAT	2	6	4295	4300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384895186
94	NC_017360	A	6	6	4329	4334	100 %	0 %	0 %	0 %	384895186
95	NC_017360	T	7	7	4442	4448	0 %	100 %	0 %	0 %	384895186
96	NC_017360	T	7	7	4471	4477	0 %	100 %	0 %	0 %	384895186
97	NC_017360	ATT	2	6	4505	4510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384895186
98	NC_017360	GA	3	6	4513	4518	50 %	0 %	50 %	0 %	384895186
99	NC_017360	ATGC	2	8	4610	4617	25 %	25 %	25 %	25 %	384895186
100	NC_017360	TGTA	2	8	4660	4667	25 %	50 %	25 %	0 %	384895186
101	NC_017360	AAT	2	6	4685	4690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384895186
102	NC_017360	TTG	2	6	4701	4706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384895186
103	NC_017360	CT	3	6	4730	4735	0 %	50 %	0 %	50 %	384895186
104	NC_017360	TAC	2	6	4760	4765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384895186
105	NC_017360	CTT	2	6	4774	4779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384895186
106	NC_017360	A	6	6	4827	4832	100 %	0 %	0 %	0 %	384895186
107	NC_017360	GTT	2	6	4848	4853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384895186
108	NC_017360	T	6	6	4952	4957	0 %	100 %	0 %	0 %	384895186
109	NC_017360	AAG	2	6	4983	4988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384895186
110	NC_017360	A	7	7	4994	5000	100 %	0 %	0 %	0 %	384895186
111	NC_017360	CAT	2	6	5014	5019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384895186
112	NC_017360	A	6	6	5029	5034	100 %	0 %	0 %	0 %	384895186
113	NC_017360	TGT	2	6	5052	5057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384895186
114	NC_017360	ATT	2	6	5163	5168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384895186
115	NC_017360	TG	3	6	5281	5286	0 %	50 %	50 %	0 %	384895187
116	NC_017360	AAATAG	2	12	5288	5299	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384895187
117	NC_017360	ATA	2	6	5308	5313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384895187
118	NC_017360	TGAT	2	8	5356	5363	25 %	50 %	25 %	0 %	384895187
119	NC_017360	TAC	2	6	5433	5438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384895187
120	NC_017360	A	6	6	5476	5481	100 %	0 %	0 %	0 %	384895187
121	NC_017360	AAAAT	2	10	5495	5504	80 %	20 %	0 %	0 %	384895187
122	NC_017360	CCA	2	6	5615	5620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384895187
123	NC_017360	CAT	3	9	5696	5704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384895187
124	NC_017360	AAT	2	6	5715	5720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384895187
125	NC_017360	TTTTA	2	10	5733	5742	20 %	80 %	0 %	0 %	384895187
126	NC_017360	AACA	2	8	5751	5758	75 %	0 %	0 %	25 %	384895187
127	NC_017360	TTC	2	6	5762	5767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384895187
128	NC_017360	AATT	2	8	5798	5805	50 %	50 %	0 %	0 %	384895187
129	NC_017360	TC	3	6	5806	5811	0 %	50 %	0 %	50 %	384895187
130	NC_017360	TGCT	2	8	5819	5826	0 %	50 %	25 %	25 %	384895187
131	NC_017360	GATT	2	8	5980	5987	25 %	50 %	25 %	0 %	384895187
132	NC_017360	CTT	3	9	6020	6028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384895188
133	NC_017360	CTT	2	6	6089	6094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384895188
134	NC_017360	C	6	6	6106	6111	0 %	0 %	0 %	100 %	384895188
135	NC_017360	A	6	6	6121	6126	100 %	0 %	0 %	0 %	384895188
136	NC_017360	GCCT	2	8	6194	6201	0 %	25 %	25 %	50 %	384895188
137	NC_017360	CTT	2	6	6290	6295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384895188
138	NC_017360	T	7	7	6311	6317	0 %	100 %	0 %	0 %	384895188
139	NC_017360	AAC	2	6	6333	6338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384895188
140	NC_017360	TGC	3	9	6350	6358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384895188
141	NC_017360	TTA	2	6	6397	6402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384895188
142	NC_017360	T	6	6	6424	6429	0 %	100 %	0 %	0 %	384895188
143	NC_017360	CATT	2	8	6452	6459	25 %	50 %	0 %	25 %	384895188
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148	NC_017360	GCT	2	6	6744	6749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384895188
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154	NC_017360	TCA	2	6	7169	7174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384895190
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271	NC_017360	ATG	2	6	13608	13613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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